عوارض بوتاکس به طور معمول، به جز ضعف عضلات مناطق اطراف محل تزریق، چشمگیر نمی باشد. البته در صورتی که تزریق توسط پزشک با تجربه انجام شود، هیچ گونه عوارضی نخواهد داشت، اما بیمارانی که دچار بیماری های عصبی و عضلانی حاد هستند و يا زنان باردار و شيرده نباید از آمپول بوتاکس استفاده کنند،علاوه بر اين، دیده شده تزریق بوتاکس باعث فروکش کردن سردردهای میگرنی در خیلی از افراد می شود.